MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 5333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007412	TAA	2	6	423	428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812662
2	NC_007412	AATA	2	8	489	496	75 %	25 %	0 %	0 %	75812662
3	NC_007412	AAT	2	6	528	533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812662
4	NC_007412	TAA	2	6	552	557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812662
5	NC_007412	CCT	2	6	559	564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812662
6	NC_007412	GCAAA	2	10	653	662	60 %	0 %	20 %	20 %	75812662
7	NC_007412	CTTTG	2	10	689	698	0 %	60 %	20 %	20 %	75812662
8	NC_007412	GAA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812662
9	NC_007412	TGC	2	6	774	779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812662
10	NC_007412	ATA	2	6	799	804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812662
11	NC_007412	ACCC	2	8	809	816	25 %	0 %	0 %	75 %	75812662
12	NC_007412	ACC	2	6	858	863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812662
13	NC_007412	CCA	2	6	904	909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812662
14	NC_007412	AGT	2	6	933	938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812662
15	NC_007412	A	6	6	991	996	100 %	0 %	0 %	0 %	75812662
16	NC_007412	A	6	6	1008	1013	100 %	0 %	0 %	0 %	75812662
17	NC_007412	AAT	2	6	1018	1023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812662
18	NC_007412	AGT	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812662
19	NC_007412	AGT	2	6	1041	1046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812662
20	NC_007412	CCAG	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	75812662
21	NC_007412	AAAC	2	8	1160	1167	75 %	0 %	0 %	25 %	75812662
22	NC_007412	GATT	2	8	1199	1206	25 %	50 %	25 %	0 %	75812662
23	NC_007412	ACT	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812662
24	NC_007412	CCATT	2	10	1271	1280	20 %	40 %	0 %	40 %	75812662
25	NC_007412	TGT	2	6	1314	1319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812662
26	NC_007412	CAG	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812662
27	NC_007412	CAA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812662
28	NC_007412	ATC	2	6	1465	1470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812662
29	NC_007412	CTA	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812662
30	NC_007412	GTA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812662
31	NC_007412	CAG	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812662
32	NC_007412	CCAAA	2	10	1648	1657	60 %	0 %	0 %	40 %	75812662
33	NC_007412	CATCC	2	10	1837	1846	20 %	20 %	0 %	60 %	75812663
34	NC_007412	GGTTT	2	10	1850	1859	0 %	60 %	40 %	0 %	75812663
35	NC_007412	AGA	2	6	1971	1976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812663
36	NC_007412	GTT	2	6	2077	2082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
37	NC_007412	CTG	2	6	2252	2257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
38	NC_007412	CAC	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812663
39	NC_007412	GTTG	2	8	2316	2323	0 %	50 %	50 %	0 %	75812663
40	NC_007412	AGC	2	6	2351	2356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812663
41	NC_007412	TTGG	2	8	2422	2429	0 %	50 %	50 %	0 %	75812663
42	NC_007412	TAG	2	6	2457	2462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
43	NC_007412	ACC	2	6	2474	2479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812663
44	NC_007412	AAAG	2	8	2495	2502	75 %	0 %	25 %	0 %	75812663
45	NC_007412	CTG	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
46	NC_007412	ATTTA	2	10	2633	2642	40 %	60 %	0 %	0 %	75812663
47	NC_007412	C	6	6	2685	2690	0 %	0 %	0 %	100 %	75812663
48	NC_007412	A	6	6	2696	2701	100 %	0 %	0 %	0 %	75812663
49	NC_007412	GTAT	2	8	2996	3003	25 %	50 %	25 %	0 %	75812663
50	NC_007412	GCG	2	6	3074	3079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812663
51	NC_007412	AGC	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812663
52	NC_007412	TTC	2	6	3167	3172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812663
53	NC_007412	AAC	2	6	3339	3344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812663
54	NC_007412	CAG	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812663
55	NC_007412	TTC	2	6	3371	3376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812663
56	NC_007412	GAA	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812663
57	NC_007412	GAA	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812663
58	NC_007412	CAG	2	6	3568	3573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812663
59	NC_007412	ACC	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812663
60	NC_007412	TCC	2	6	3701	3706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812663
61	NC_007412	CAA	2	6	3742	3747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812663
62	NC_007412	TGC	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
63	NC_007412	TTCA	2	8	3779	3786	25 %	50 %	0 %	25 %	75812663
64	NC_007412	AAT	2	6	3788	3793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812663
65	NC_007412	GCT	2	6	3834	3839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
66	NC_007412	TGC	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
67	NC_007412	GAG	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812663
68	NC_007412	CAA	2	6	3965	3970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812663
69	NC_007412	CTTCTG	2	12	4063	4074	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75812663
70	NC_007412	CTG	2	6	4095	4100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
71	NC_007412	TA	3	6	4156	4161	50 %	50 %	0 %	0 %	75812663
72	NC_007412	CTG	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
73	NC_007412	GTT	2	6	4209	4214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
74	NC_007412	TA	3	6	4247	4252	50 %	50 %	0 %	0 %	75812663
75	NC_007412	TGT	2	6	4317	4322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
76	NC_007412	CTG	2	6	4495	4500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
77	NC_007412	CAC	2	6	4540	4545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812663
78	NC_007412	TAT	2	6	4615	4620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812663
79	NC_007412	GAC	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812663
80	NC_007412	TA	3	6	4717	4722	50 %	50 %	0 %	0 %	75812663
81	NC_007412	T	6	6	4763	4768	0 %	100 %	0 %	0 %	75812663
82	NC_007412	TGTA	2	8	4796	4803	25 %	50 %	25 %	0 %	75812663
83	NC_007412	AGTT	2	8	4808	4815	25 %	50 %	25 %	0 %	75812663
84	NC_007412	GAAG	2	8	4854	4861	50 %	0 %	50 %	0 %	75812663
85	NC_007412	CTT	2	6	4915	4920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812663
86	NC_007412	TTC	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812663
87	NC_007412	CACAA	2	10	4957	4966	60 %	0 %	0 %	40 %	75812663
88	NC_007412	AGG	2	6	5005	5010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812663
89	NC_007412	CAT	2	6	5029	5034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812663
90	NC_007412	ATA	2	6	5042	5047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812663
91	NC_007412	TGG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812663
92	NC_007412	GAT	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
93	NC_007412	AT	3	6	5136	5141	50 %	50 %	0 %	0 %	75812663
94	NC_007412	TGT	2	6	5187	5192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
95	NC_007412	TGA	2	6	5238	5243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
96	NC_007412	GTA	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
97	NC_007412	TAA	2	6	5273	5278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812663
98	NC_007412	TGT	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
99	NC_007412	CCA	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812663
100	NC_007412	A	6	6	5454	5459	100 %	0 %	0 %	0 %	75812663
101	NC_007412	TAT	2	6	5479	5484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812663
102	NC_007412	GTAG	2	8	5491	5498	25 %	25 %	50 %	0 %	75812663
103	NC_007412	TTG	2	6	5504	5509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
104	NC_007412	TTG	2	6	5552	5557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
105	NC_007412	TGA	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
106	NC_007412	TAAT	2	8	5592	5599	50 %	50 %	0 %	0 %	75812663
107	NC_007412	T	6	6	5599	5604	0 %	100 %	0 %	0 %	75812663
108	NC_007412	TAA	2	6	5621	5626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812663
109	NC_007412	TGT	2	6	5687	5692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
110	NC_007412	TTG	2	6	5747	5752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
111	NC_007412	AAT	2	6	5784	5789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812663
112	NC_007412	GTT	2	6	5887	5892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
113	NC_007412	TAA	2	6	5999	6004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812663
114	NC_007412	TGT	2	6	6027	6032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
115	NC_007412	CCG	2	6	6051	6056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812663
116	NC_007412	GTT	2	6	6117	6122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
117	NC_007412	GGC	2	6	6127	6132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812663
118	NC_007412	CAC	2	6	6152	6157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812663
119	NC_007412	AT	4	8	6188	6195	50 %	50 %	0 %	0 %	75812663
120	NC_007412	GTT	2	6	6244	6249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
121	NC_007412	TCA	2	6	6267	6272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812663
122	NC_007412	TCA	2	6	6346	6351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812663
123	NC_007412	AGT	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
124	NC_007412	TGTT	2	8	6407	6414	0 %	75 %	25 %	0 %	75812663
125	NC_007412	CAA	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812663
126	NC_007412	AGT	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
127	NC_007412	ATG	2	6	6548	6553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
128	NC_007412	GCT	2	6	6581	6586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
129	NC_007412	ACG	2	6	6587	6592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812663
130	NC_007412	GTG	2	6	6613	6618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812663
131	NC_007412	TCT	2	6	6675	6680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812663
132	NC_007412	TCT	2	6	6708	6713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812663
133	NC_007412	TCAAA	2	10	6772	6781	60 %	20 %	0 %	20 %	75812663
134	NC_007412	GTATCA	2	12	6894	6905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75812663
135	NC_007412	TCT	2	6	6957	6962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812663
136	NC_007412	TGC	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
137	NC_007412	ATTG	2	8	7017	7024	25 %	50 %	25 %	0 %	75812663
138	NC_007412	TG	3	6	7023	7028	0 %	50 %	50 %	0 %	75812663
139	NC_007412	TGT	2	6	7098	7103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
140	NC_007412	TAC	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812663
141	NC_007412	GAATC	2	10	7156	7165	40 %	20 %	20 %	20 %	75812663
142	NC_007412	A	6	6	7178	7183	100 %	0 %	0 %	0 %	75812663
143	NC_007412	G	6	6	7261	7266	0 %	0 %	100 %	0 %	75812663
144	NC_007412	CTG	2	6	7293	7298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
145	NC_007412	CCACAA	2	12	7360	7371	50 %	0 %	0 %	50 %	75812663
146	NC_007412	GCA	2	6	7381	7386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812663
147	NC_007412	GTT	2	6	7399	7404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
148	NC_007412	T	6	6	7403	7408	0 %	100 %	0 %	0 %	75812663
149	NC_007412	CTG	2	6	7442	7447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
150	NC_007412	GTAA	2	8	7633	7640	50 %	25 %	25 %	0 %	75812663
151	NC_007412	GGT	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812663
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153	NC_007412	GAC	2	6	7843	7848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812663
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155	NC_007412	GTT	2	6	7914	7919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
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157	NC_007412	TGA	2	6	8040	8045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
158	NC_007412	TTGA	2	8	8093	8100	25 %	50 %	25 %	0 %	75812663
159	NC_007412	ACA	2	6	8122	8127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812663
160	NC_007412	TAAC	2	8	8173	8180	50 %	25 %	0 %	25 %	75812663
161	NC_007412	CCA	2	6	8184	8189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812663
162	NC_007412	CAA	2	6	8192	8197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812663
163	NC_007412	C	6	6	8200	8205	0 %	0 %	0 %	100 %	75812663
164	NC_007412	CA	3	6	8253	8258	50 %	0 %	0 %	50 %	75812663
165	NC_007412	TGA	2	6	8316	8321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
166	NC_007412	ATA	2	6	8367	8372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812663
167	NC_007412	CAGG	2	8	8400	8407	25 %	0 %	50 %	25 %	75812663
168	NC_007412	TCTA	2	8	8444	8451	25 %	50 %	0 %	25 %	75812663
169	NC_007412	ACCTGA	2	12	8460	8471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812663
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171	NC_007412	CAA	2	6	8489	8494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812663
172	NC_007412	TGC	2	6	8496	8501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812663
173	NC_007412	ATA	2	6	8535	8540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812663
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176	NC_007412	TTG	2	6	8738	8743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
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178	NC_007412	TGT	2	6	8778	8783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
179	NC_007412	TGA	2	6	8802	8807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812663
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181	NC_007412	TGT	2	6	8865	8870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812663
182	NC_007412	AG	3	6	8884	8889	50 %	0 %	50 %	0 %	75812663
183	NC_007412	ACC	2	6	8927	8932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812663
184	NC_007412	CTGTA	2	10	8989	8998	20 %	40 %	20 %	20 %	75812663
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222	NC_007412	A	6	6	10732	10737	100 %	0 %	0 %	0 %	75812664
223	NC_007412	ATTC	2	8	10752	10759	25 %	50 %	0 %	25 %	75812664
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231	NC_007412	GA	3	6	10955	10960	50 %	0 %	50 %	0 %	75812664
232	NC_007412	GTT	2	6	11009	11014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812664
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234	NC_007412	TAA	2	6	11113	11118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812664
235	NC_007412	CCT	2	6	11320	11325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812665
236	NC_007412	TAA	2	6	11411	11416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812665
237	NC_007412	GTTT	2	8	11568	11575	0 %	75 %	25 %	0 %	75812665
238	NC_007412	GTG	2	6	11611	11616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812665
239	NC_007412	ATC	2	6	11642	11647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812665
240	NC_007412	T	7	7	11751	11757	0 %	100 %	0 %	0 %	75812665
241	NC_007412	AAG	2	6	11760	11765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812665
242	NC_007412	GCT	2	6	11827	11832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812665
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244	NC_007412	TTTA	2	8	11867	11874	25 %	75 %	0 %	0 %	75812665
245	NC_007412	TAACTT	2	12	11932	11943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812665
246	NC_007412	TAA	2	6	11981	11986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812665
247	NC_007412	TC	3	6	12056	12061	0 %	50 %	0 %	50 %	75812665
248	NC_007412	GAT	2	6	12208	12213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812665
249	NC_007412	TCA	2	6	12222	12227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812665
250	NC_007412	CAA	2	6	12421	12426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812666
251	NC_007412	TTG	2	6	12437	12442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812666
252	NC_007412	ACA	2	6	12447	12452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812666
253	NC_007412	AT	3	6	12489	12494	50 %	50 %	0 %	0 %	75812666
254	NC_007412	TAA	2	6	12505	12510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812666
255	NC_007412	AATA	2	8	12536	12543	75 %	25 %	0 %	0 %	75812666
256	NC_007412	TAA	2	6	12632	12637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812666
257	NC_007412	GAA	2	6	12655	12660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812666
258	NC_007412	GATT	2	8	12661	12668	25 %	50 %	25 %	0 %	75812666
259	NC_007412	TA	3	6	12728	12733	50 %	50 %	0 %	0 %	75812666
260	NC_007412	CTG	2	6	12745	12750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812666
261	NC_007412	ATA	2	6	12816	12821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812666
262	NC_007412	T	6	6	12854	12859	0 %	100 %	0 %	0 %	75812666
263	NC_007412	CAG	2	6	12866	12871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812666
264	NC_007412	TAA	2	6	12968	12973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812666
265	NC_007412	ACC	2	6	12978	12983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812666
266	NC_007412	AACG	2	8	12990	12997	50 %	0 %	25 %	25 %	75812666
267	NC_007412	CTG	2	6	13024	13029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812666
268	NC_007412	AATTC	2	10	13075	13084	40 %	40 %	0 %	20 %	75812666
269	NC_007412	TAAG	2	8	13089	13096	50 %	25 %	25 %	0 %	75812666
270	NC_007412	TAC	2	6	13112	13117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812666
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275	NC_007412	AAT	2	6	13277	13282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812666
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277	NC_007412	CTG	2	6	13330	13335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812666
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303	NC_007412	TGC	2	6	14658	14663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812667
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402	NC_007412	GTT	2	6	19881	19886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812670
403	NC_007412	TTG	2	6	19942	19947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812670
404	NC_007412	CTA	2	6	19995	20000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812670
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430	NC_007412	TAA	2	6	21067	21072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812670
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